L'Associazione MUS-E Italia Onlus nasce nel 1999 a Milano con il compito di promuovere e coordinare il Progetto europeo nel nostro Paese.
Da allora, MUS-E Italia non ha mai smesso di crescere e oggi è una delle realtà MUS-E più importanti in Europa.
L'Associazione Nazionale promuove la nascita di nuove Sedi Locali, ne coordina il lavoro progettuale, organizzativo e artistico e organizza incontri nazionali e internazionali con gli altri Paesi MUS-E.

Il progetto MUS-E è offerto gratuitamente a tutti i bambini delle classi che partecipano al nostro programma.

MUS-E Italia cura la formazione degli artisti di tutta la rete italiana, con un seminario annuale di alcuni giorni condotto da grandi Maestri della cultura nazionali ed internazionali e sovrintende, insieme ai coordinatori locali, alla selezione degli artisti delle nuove sedi.
Attiva e tiene i contatti con le Istituzioni Pubbliche e private nazionali.
Inoltre, compito di MUS-E Italia Onlus è la ricerca fondi, la comunicazione, lo sviluppo della rete, le relazioni internazionali, il monitoraggio e la valutazione delle attività svolte nelle sedi locali.
Personalità dell'imprenditoria, delle professioni e della cultura presiedono le nostre Sedi Locali, attive nelle città italiane dove i problemi della multietnicità e dell'emarginazione sociale sono più rilevanti.

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Il progetto MUS-E è attivo a Napoli dall’anno scolastico 2005/2006. Il 18 luglio 2005 si costituisce l’Associazione MUS-E Napoli Onlus. Hanno partecipato al progetto 14 scuole primarie per un totale di 44 classi, coinvolgendo circa 860 bambini e 18 artisti.